2013年1月，港湾院首次在已经开展23年的上海市重大工程立功竞赛活动中荣膺优秀公司的光荣称号，证明这项上海市传统竞赛活动在比拼工程建设单位实力和成果的基础上，增加了科技水平和企业智慧的评比标准。港湾院在其参与的国家及区域重大工程中，以极高的科技含量，精湛的工艺水平获比赛荣誉，实至名归。港湾院作为三航局的科技排头兵，在各项大型工程担当起科技先锋的重责，在应用技术方面已进入国内先进水平行列，在“科技是第一生产力”达到社会共识的今天，港湾院被评为上海市重大工程立功竞赛活动优秀公司也是传统观念上的突破。